阅读 42

机器学习(十五) K-means 算法

1 简介

K-means称为K-平均算法,简单来讲K-平均聚类算法的目的就是:

把 n个点(可以是样本的一次观察或一个实例)划分到k个聚类中,使得每个点都属于离他最近的均值(此即聚类中心)对应的聚类,以之作为聚类的标准。

已知观测集 (x1,x2,...,xn),其中每个观测都是一个 d-维实向量,k-平均聚类要把这 n个观测划分到k个集合中(k≤n),使得组内平方和(WCSS within-cluster sum of squares)最小。换句话说,它的目标是找到使得下式满足的聚类 Si

其中 μi是 Si中所有点的均值。

2 算法流程

步骤1 分配(Assignment)

将每个观测分配到聚类中,使得组内平方和(WCSS)达到最小。 因为这一平方和就是平方后的欧氏距离,所以很直观地把观测分配到离它最近得均值点即可 。

步骤2 更新(Update)

对于上一步得到的每一个聚类,以聚类中观测值的图心,作为新的均值点。

这一算法经常被描述为“把观测按照距离分配到最近的聚类”。标准算法的目标函数是组内平方和(WCSS),而且按照“最小二乘和”来分配观测,确实是等价于按照最小欧氏距离来分配观测的。如果使用不同的距离函数来代替(平方)欧氏距离,可能使得算法无法收敛。然而,使用不同的距离函数,也能得到k-均值聚类的其他变体,如球体k-均值算法和k-中心点算法。

3 代码实例

# !/usr/bin/env python3
# -*- coding:utf-8 _*-
"""
@Author:yanqiang
@File: k-means.py
@Time: 2019/1/17 14:08
@Software: PyCharm
@Description:
"""
# 导入库
import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt

# 步骤1:初始化
df = pd.DataFrame({
    'x': [12, 20, 28, 18, 29, 33, 24, 45, 45, 52, 51, 52, 55, 53, 55, 61, 64, 69, 72],
    'y': [39, 36, 30, 52, 54, 46, 55, 59, 63, 70, 66, 63, 58, 23, 14, 8, 19, 7, 24]
})
np.random.seed(300)

# 随机初始化三个聚类中心
k = 3
centroids = {i + 1: [np.random.randint(0, 80), np.random.randint(0, 80)] for i in range(k)}  # centroids[i] = [x, y]

fig = plt.figure(figsize=(5, 5))
plt.scatter(df['x'], df['y'], color='k')
colors = {1: 'b', 2: 'r', 3: 'g'}
for i in centroids.keys():
    plt.scatter(*centroids[i], color=colors[i])
plt.xlim(0, 80)
plt.ylim(0, 80)
plt.show()  # 画图
复制代码

初始化

# 步骤2:Assignment 分配
# 将点归类到与聚类中心距离最短的类别
def assignment(df, centroids):
    for i in centroids.keys():
        # sqrt((x1-x2)^2+(y1-y2)^2)
        df['distance_from_{}'.format(i)] = (
            np.sqrt(
                (df['x'] - centroids[i][0]) ** 2
                + (df['y'] - centroids[i][1]) ** 2
            )
        )
    centroids_distance_cols = ['distance_from_{}'.format(i) for i in centroids.keys()]
    df['closest'] = df.loc[:, centroids_distance_cols].idxmin(axis=1)  # ?
    df['closest'] = df['closest'].map(lambda x: int(x.lstrip('distance_from_')))
    df['color'] = df['closest'].map(lambda x: colors[x])
    return df


df = assignment(df, centroids)
print(df.head())

fig = plt.figure(figsize=(5, 5))
plt.scatter(df['x'], df['y'], color=df['color'], alpha=0.5, edgecolors='k')
for i in centroids.keys():
    plt.scatter(*centroids[i], color=colors[i])
plt.xlim(0, 80)
plt.ylim(0, 80)
plt.show()
复制代码

将点归类到与聚类中心距离最短的类别

# 步骤3 :Update 更新
# 重新计算每个聚类的质心
import copy

old_centroids = copy.deepcopy(centroids)


def update(k):
    for i in centroids.keys():
        centroids[i][0] = np.mean(df[df['closest'] == i]['x'])
        centroids[i][1] = np.mean(df[df['closest'] == i]['y'])
    return k


centroids = update(centroids)

fig = plt.figure(figsize=(5, 5))
ax = plt.axes()
plt.scatter(df['x'], df['y'], color=df['color'], alpha=0.5, edgecolor='k')
for i in centroids.keys():
    plt.scatter(*centroids[i], color=colors[i])
plt.xlim(0, 80)
plt.ylim(0, 80)
for i in old_centroids.keys():
    old_x = old_centroids[i][0]
    old_y = old_centroids[i][1]
    dx = (centroids[i][0] - old_centroids[i][0]) * 0.75
    dy = (centroids[i][1] - old_centroids[i][1]) * 0.75
    ax.arrow(old_x, old_y, dx, dy, head_width=2, head_length=3, fc=colors[i], ec=colors[i])
plt.show()
复制代码

更新聚类中心

# 步骤4 重新分配 Repeat Assigment
# 重新将点归类到与新聚类中心距离最短的类别

df = assignment(df, centroids)

# 画图
fig = plt.figure(figsize=(5, 5))
plt.scatter(df['x'], df['y'], color=df['color'], alpha=0.5, edgecolor='k')
for i in centroids.keys():
    plt.scatter(*centroids[i], color=colors[i])
plt.xlim(0, 80)
plt.ylim(0, 80)
plt.show()
复制代码

更新聚类中心之后的聚类分布

# 步骤5 一直重复上面的步骤,直到每个的点所属的聚类中心不再更新
while True:
    closest_centroids = df['closest'].copy(deep=True)
    centroids = update(centroids)
    df = assignment(df, centroids)
    if closest_centroids.equals(df['closest']):
        df.to_csv('cal_process.csv')
        break

fig = plt.figure(figsize=(5, 5))
plt.scatter(df['x'], df['y'], color=df['color'], alpha=0.5, edgecolor='k')
for i in centroids.keys():
    plt.scatter(*centroids[i], color=colors[i])
plt.xlim(0, 80)
plt.ylim(0, 80)
plt.show()

复制代码

最终聚类效果

我们将df导出之后可以看到,每个点的所属分类

具体分类

4 参考资料

  1. k-平均算法 维基百科
  2. K-means聚类算法
  3. 数据挖掘十大算法--K-均值聚类算法

我的简书:致Great

关注下面的标签,发现更多相似文章
评论