Spark学习——性能调优(一)

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Spark的性能调优主要有以下几个方向:

  • 常规性能调优:分配资源、并行度、RDD架构与缓存等
  • JVM调优(Java虚拟机):JVM相关的参数,通常情况下,如果你的硬件配置、基础的JVM的配置,都ok的话,JVM通常不会造成太严重的性能问题;反而更多的是,在troubleshooting中,JVM占了很重要的地位;JVM造成线上的spark作业的运行报错,甚至失败(比如OOM)。
  • shuffle调优(相当重要):spark在执行groupByKey、reduceByKey等操作时的,shuffle环节的调优。这个很重要。shuffle调优,其实对spark作业的性能的影响,是相当之高!!!经验:在spark作业的运行过程中,只要一牵扯到有shuffle的操作,基本上shuffle操作的性能消耗,要占到整个spark作业的50%~90%。10%用来运行map等操作,90%耗费在两个shuffle操作。groupByKey、countByKey。
  • spark操作调优(spark算子调优,比较重要):groupByKey,countByKey或aggregateByKey来重构实现。有些算子的性能,是比其他一些算子的性能要高的。foreachPartition替代foreach。如果一旦遇到合适的情况,效果还是不错的。

按照优化效果简单排序:

  1. 分配资源、并行度、RDD架构与缓存
  2. shuffle调优
  3. spark算子调优
  4. JVM调优、广播大变量、Kryo、fastUtil

本系列主要讲解:

  • 性能调优
    • 分配更多资源
    • 调节并行度
    • 重构RDD架构及持久化RDD
    • 广播大变量
    • Kryo序列化
    • fastUtil优化
    • 调节数据本地化等待时长
  • JVM调优
    • 降低cache操作的内存占比
    • 调节executor堆外内存
    • 调节连接等待时长
  • Shuffle调优
    • 合并map端输出文件
    • 调节map端内存缓存和reduce端内存占比
    • SortShuffleManager调优
  • 算子调优
    • 使用MapPartition提升性能
    • filter过后使用coalesce减少分区数量
    • 使用foreachPartition优化
    • 使用repatition解决Spark SQL低并行度
    • 使用reduceByKey本地聚合

分配更多资源

性能调优的王道,就是增加和分配更多的资源,性能和速度上的提升,是显而易见的;基本上,在一定范围之内,增加资源与性能的提升,是成正比的;写完了一个复杂的spark作业之后,进行性能调优的时候,首先第一步,我觉得,就是要来调节最优的资源配置;在这个基础之上,如果说你的spark作业,能够分配的资源达到了你的能力范围的顶端之后,无法再分配更多的资源了,公司资源有限;那么才是考虑去做后面的这些性能调优的点。

分配哪些资源?

  • executor数量
  • 每个executor的cpu core数量
  • 每个executor的内存大小
  • driver内存大小

在哪里分配这些资源?

在我们在生产环境中,提交spark作业时,用的spark-submit shell脚本,里面调整对应的参数

/usr/local/spark/bin/spark-submit \
--class cn.spark.sparktest.core.WordCountCluster \
--num-executors 3 \  配置executor的数量
--driver-memory 100m \  配置driver的内存(影响不大)
--executor-memory 100m \  配置每个executor的内存大小
--executor-cores 3 \  配置每个executor的cpu core数量
/usr/local/SparkTest-0.0.1-SNAPSHOT-jar-with-dependencies.jar \

为什么多分配了这些资源以后,性能会得到提升?

如上图所示,Driver中的SparkContext,DAGScheduler,TaskScheduler,会将我们的算子,切割成大量的task,提交到Application的executor上面去执行。假设我们最后切割出了100个task任务。

增加executor

如果executor数量比较少,那么,能够并行执行的task数量就比较少,就意味着,我们的Application的并行执行的能力就很弱。
比如有3个executor,每个executor有2个cpu core,那么同时能够并行执行的task,就是6个。6个执行完以后,再换下一批6个task。 增加了executor数量以后,那么,就意味着,能够并行执行的task数量,也就变多了。比如原先是6个,现在可能可以并行执行10个,甚至20个,100个。那么并行能力就比之前提升了数倍,数十倍。 相应的,性能(执行的速度),也能提升数倍~数十倍。

增加每个executor的cpu core

增加每个executor的cpu core,也是增加了执行的并行能力。原本20个executor,每个才2个cpu core。能够并行执行的task数量,就是40个task。
现在每个executor的cpu core,增加到了5个。能够并行执行的task数量,就是100个task。 执行的速度,提升了2.5倍。

增加每个executor的内存量。

增加了内存量以后,对性能的提升,有三点:

  1. 如果需要对RDD进行cache,那么更多的内存,就可以缓存更多的数据,将更少的数据写入磁盘,甚至不写入磁盘。减少了磁盘IO。
  2. 对于shuffle操作,reduce端,会需要内存来存放拉取的数据并进行聚合。如果内存不够,也会写入磁盘。如果给executor分配更多内存以后,就有更少的数据,需要写入磁盘,甚至不需要写入磁盘。减少了磁盘IO,提升了性能。
  3. 对于task的执行,可能会创建很多对象。如果内存比较小,可能会频繁导致JVM堆内存满了,然后频繁GC,垃圾回收,minor GC和full GC。(速度很慢)。内存加大以后,带来更少的GC,垃圾回收,避免了速度变慢,速度变快了。

调节并行度

并行度:其实就是指的是,Spark作业中,各个stage的task数量,也就代表了Spark作业的在各个阶段(stage)的并行度。

如果并行度过低,会怎么样?

假设,现在已经在spark-submit脚本里面,给我们的spark作业分配了足够多的资源,比如50个executor,每个executor有10G内存,每个executor有3个cpu core。基本已经达到了集群或者yarn队列的资源上限。

task没有设置,或者设置的很少,比如就设置了,100个task。50个executor,每个executor有3个cpu core,也就是说,你的Application任何一个stage运行的时候,都有总数在150个cpu core,可以并行运行。但是你现在,只有100个task,平均分配一下,每个executor分配到2个task,ok,那么同时在运行的task,只有100个,每个executor只会并行运行2个task。每个executor剩下的一个cpu core,就浪费掉了。

你的资源虽然分配足够了,但是问题是,并行度没有与资源相匹配,导致你分配下去的资源都浪费掉了。

合理的并行度的设置

应该是要设置的足够大,大到可以完全合理的利用你的集群资源;比如上面的例子,总共集群有150个cpu core,可以并行运行150个task。那么就应该将你的Application的并行度,至少设置成150,才能完全有效的利用你的集群资源,让150个task,并行执行;而且task增加到150个以后,即可以同时并行运行,还可以让每个task要处理的数据量变少;比如总共150G的数据要处理,如果是100个task,每个task计算1.5G的数据;现在增加到150个task,可以并行运行,而且每个task主要处理1G的数据就可以。

很简单的道理,只要合理设置并行度,就可以完全充分利用你的集群计算资源,并且减少每个task要处理的数据量,最终,就是提升你的整个Spark作业的性能和运行速度。

  1. task数量,至少设置成与Spark application的总cpu core数量相同(最理想情况,比如总共150个cpu core,分配了150个task,一起运行,差不多同一时间运行完毕)
  2. 官方是推荐,task数量,设置成spark application总cpu core数量的2~3倍,比如150个cpu core,基本要设置task数量为300~500;

实际情况,与理想情况不同的,有些task会运行的快一点,比如50s就完了,有些task,可能会慢一点,要1分半才运行完,所以如果你的task数量,刚好设置的跟cpu core数量相同,可能还是会导致资源的浪费,因为,比如150个task,10个先运行完了,剩余140个还在运行,但是这个时候,有10个cpu core就空闲出来了,就导致了浪费。那如果task数量设置成cpu core总数的2~3倍,那么一个task运行完了以后,另一个task马上可以补上来,就尽量让cpu core不要空闲,同时也是尽量提升spark作业运行的效率和速度,提升性能。

如何设置一个Spark Application的并行度?

spark.default.parallelism 
SparkConf conf = new SparkConf()
  .set("spark.default.parallelism", "500")

重构RDD架构和持久化RDD

  • 如上图第一条DAG,默认情况下,多次对一个RDD执行算子,去获取不同的RDD;都会对这个RDD以及之前的父RDD,全部重新计算一次;所以在计算RDD3和RDD4的时候,前面的读取HDFS文件,然后对RDD1执行算子,获取 到RDD2会计算两遍。
    这种情况,是绝对绝对,一定要避免的,一旦出现一个RDD重复计算的情况,就会导致性能急剧降低。比如,HDFS->RDD1-RDD2的时间是15分钟,那么此时就要走两遍,变成30分钟。

  • 另外一种情况,在上图第二条DAG中国,从一个RDD到几个不同的RDD,算子和计算逻辑其实是完全一样的,结果因为人为的疏忽,计算了多次,获取到了多个RDD。这个也是尽量要避免的。

如何重构RDD架构

  • 1. RDD架构重构与优化
    尽量去复用RDD,差不多的RDD,可以抽取称为一个共同的RDD,供后面的RDD计算时,反复使用。

  • 2. 公共RDD一定要实现持久化
    对于要多次计算和使用的公共RDD,一定要进行持久化。
    持久化,也就是说,将RDD的数据缓存到内存中/磁盘中,(BlockManager),以后无论对这个RDD做多少次计算,那么都是直接取这个RDD的持久化的数据,比如从内存中或者磁盘中,直接提取一份数据。

  • 3. 持久化,是可以进行序列化的
    如果正常将数据持久化在内存中,那么可能会导致内存的占用过大,这样的话,也许,会导致OOM内存溢出。
    当纯内存无法支撑公共RDD数据完全存放的时候,就优先考虑,使用序列化的方式在纯内存中存储。将RDD的每个partition的数据,序列化成一个大的字节数组,就一个对象;序列化后,大大减少内存的空间占用。
    序列化的方式,唯一的缺点就是,在获取数据的时候,需要反序列化。

  • 4. 为了数据的高可靠性,而且内存充足,可以使用双副本机制,进行持久化
    持久化的双副本机制,持久化后的一个副本,因为机器宕机了,副本丢了,就还是得重新计算一次;持久化的每个数据单元,存储一份副本,放在其他节点上面;从而进行容错;一个副本丢了,不用重新计算,还可以使用另外一份副本。
    这种方式,仅仅针对你的内存资源极度充足

广播大变量

关于广播可以阅读 Spark学习(二)——RDD基础 中的共享变量。

为什么要使用广播大变量

task执行的算子中,使用了外部的变量,然后driver会把变量以task的形式发送到excutor端,每个task都会获取一份变量的副本。如果有很多个task,就会有很多给excutor端携带很多个变量,如果这个变量非常大的时候,就可能会造成内存溢出。

比如,外部变量map是1M。总共,你前面调优都调的特好,资源给的到位,配合着资源,并行度调节的绝对到位,1000个task。大量task的确都在并行运行。
这些task里面都用到了占用1M内存的map,那么首先,map会拷贝1000份副本,通过网络传输到各个task中去,给task使用。总计有1G的数据,会通过网络传输。网络传输的开销,不容乐观啊!!!网络传输,也许就会消耗掉你的spark作业运行的总时间的一小部分。
map副本,传输到了各个task上之后,是要占用内存的。1个map的确不大,1M;1000个map分布在你的集群中,一下子就耗费掉1G的内存。对性能会有什么影响呢?
不必要的内存的消耗和占用,就导致了,你在进行RDD持久化到内存,也许就没法完全在内存中放下;就只能写入磁盘,最后导致后续的操作在磁盘IO上消耗性能;
你的task在创建对象的时候,也许会发现堆内存放不下所有对象,也许就会导致频繁的垃圾回收器的回收,GC。GC的时候,一定是会导致工作线程停止,也就是导致Spark暂停工作那么一点时间。频繁GC的话,对Spark作业的运行的速度会有相当可观的影响。

广播大变量原理

  • 广播变量,初始的时候,就在Drvier上有一份副本。
  • task在运行的时候,想要使用广播变量中的数据,此时首先会在自己本地的Executor对应的BlockManager中,尝试获取变量副本;如果本地没有,那么就从Driver远程拉取变量副本,并保存在本地的BlockManager中;此后这个executor上的task,都会直接使用本地的BlockManager中的副本。
  • executor的BlockManager除了从driver上拉取,也可能从其他节点的BlockManager上拉取变量副本,距离越近越好。

使用Kryo序列化

  • 默认情况下,Spark内部是使用Java的序列化机制,ObjectOutputStream / ObjectInputStream,对象输入输出流机制,来进行序列化。这种默认序列化机制的好处在于,处理起来比较方便;也不需要我们手动去做什么事情,只是,你在算子里面使用的变量,必须是实现Serializable接口的,可序列化即可。
  • 但是缺点在于,默认的序列化机制的效率不高,序列化的速度比较慢;序列化以后的数据,占用的内存空间相对还是比较大。 可以手动进行序列化格式的优化,Spark支持使用Kryo序列化机制。Kryo序列化机制,比默认的Java序列化机制,速度要快,序列化后的数据要更小,大概是Java序列化机制的1/10。所以Kryo序列化优化以后,可以让网络传输的数据变少;在集群中耗费的内存资源大大减少。

Kryo序列化机制,一旦启用以后,会生效的几个地方:

  1. 算子函数中使用到的外部变量
    算子函数中使用到的外部变量,使用Kryo以后:优化网络传输的性能,可以优化集群中内存的占用和消耗
  2. 持久化RDD时进行序列化,StorageLevel.MEMORY_ONLY_SER等
    持久化RDD,优化内存的占用和消耗;持久化RDD占用的内存越少,task执行的时候,创建的对象,就不至于频繁的占满内存,频繁发生GC。
  3. shuffle
    可以优化网络传输的性能

如何使用Kryo

  • 首先第一步,在SparkConf中设置一个属性,spark.serializer,org.apache.spark.serializer.KryoSerializer类;
SparkConf.set("spark.serializer", "org.apache.spark.serializer.KryoSerializer")

Kryo之所以没有被作为默认的序列化类库的原因,就要出现了:主要是因为Kryo要求,如果要达到它的最佳性能的话,那么就一定要注册你自定义的类(比如,你的算子函数中使用到了外部自定义类型的对象变量,这时,就要求必须注册你的类,否则Kryo达不到最佳性能)。

  • 第二步,注册你使用到的,需要通过Kryo序列化的一些自定义
.set("spark.serializer", "org.apache.spark.serializer.KryoSerializer")
.registerKryoClasses(new Class[]{CategorySortKey.class})

使用fastUtil优化数据格式

fastutil是扩展了Java标准集合框架(Map、List、Set;HashMap、ArrayList、HashSet)的类库,提供了特殊类型的map、set、list和queue;
fastutil能够提供更小的内存占用,更快的存取速度;我们使用fastutil提供的集合类,来替代自己平时使用的JDK的原生的Map、List、Set,好处在于,fastutil集合类,可以减小内存的占用,并且在进行集合的遍历、根据索引(或者key)获取元素的值和设置元素的值的时候,提供更快的存取速度;
fastutil也提供了64位的array、set和list,以及高性能快速的,以及实用的IO类,来处理二进制和文本类型的文件; fastutil最新版本要求Java 7以及以上版本;

使用场景

Spark中应用fastutil的场景:

  1. 如果算子函数使用了外部变量;那么第一,你可以使用Broadcast广播变量优化;第二,可以使用Kryo序列化类库,提升序列化性能和效率;第三,如果外部变量是某种比较大的集合,那么可以考虑使用fastutil改写外部变量,首先从源头上就减少内存的占用,通过广播变量进一步减少内存占用,再通过Kryo序列化类库进一步减少内存占用。
  2. 在你的算子函数里,也就是task要执行的计算逻辑里面,如果有逻辑中,出现,要创建比较大的Map、List等集合,可能会占用较大的内存空间,而且可能涉及到消耗性能的遍历、存取等集合操作;那么此时,可以考虑将这些集合类型使用fastutil类库重写,使用了fastutil集合类以后,就可以在一定程度上,减少task创建出来的集合类型的内存占用。避免executor内存频繁占满,频繁唤起GC,导致性能下降。

fastutil的使用

第一步:在pom.xml中引用fastutil的包

<dependency>
    <groupId>fastutil</groupId>
    <artifactId>fastutil</artifactId>
    <version>5.0.9</version>
</dependency>

第二步:List => IntList

IntList fastutilExtractList = new IntArrayList();

调节数据本地化时长

Spark在Driver上,对Application的每一个stage的task,进行分配之前,都会计算出每个task要计算的是哪个分片数据,RDD的某个partition;Spark的task分配算法,优先,会希望每个task正好分配到它要计算的数据所在的节点,这样的话,就不用在网络间传输数据;

但是呢,通常来说,有时,事与愿违,可能task没有机会分配到它的数据所在的节点,为什么呢,可能那个节点的计算资源和计算能力都满了;所以呢,这种时候,通常来说,Spark会等待一段时间,默认情况下是3s钟(不是绝对的,还有很多种情况,对不同的本地化级别,都会去等待),到最后,实在是等待不了了,就会选择一个比较差的本地化级别,比如说,将task分配到靠它要计算的数据所在节点,比较近的一个节点,然后进行计算。

但是对于第二种情况,通常来说,肯定是要发生数据传输,task会通过其所在节点的BlockManager来获取数据,BlockManager发现自己本地没有数据,会通过一个getRemote()方法,通过TransferService(网络数据传输组件)从数据所在节点的BlockManager中,获取数据,通过网络传输回task所在节点。

对于我们来说,当然不希望是类似于第二种情况的了。最好的,当然是task和数据在一个节点上,直接从本地executor的BlockManager中获取数据,纯内存,或者带一点磁盘IO;如果要通过网络传输数据的话,那么实在是,性能肯定会下降的,大量网络传输,以及磁盘IO,都是性能的杀手。

什么时候要调节这个参数?

观察日志,spark作业的运行日志,推荐大家在测试的时候,先用client模式,在本地就直接可以看到比较全的日志。 日志里面会显示,starting task。。。,PROCESS LOCAL、NODE LOCAL 观察大部分task的数据本地化级别

如果大多都是PROCESS_LOCAL,那就不用调节了 如果是发现,好多的级别都是NODE_LOCAL、ANY,那么最好就去调节一下数据本地化的等待时长 调节完,应该是要反复调节,每次调节完以后,再来运行,观察日志 看看大部分的task的本地化级别有没有提升;看看,整个spark作业的运行时间有没有缩短

你别本末倒置,本地化级别倒是提升了,但是因为大量的等待时长,spark作业的运行时间反而增加了,那就还是不要调节了

怎么调节?

new SparkConf()
  .set("spark.locality.wait", "10")
  • spark.locality.wait,默认是3s;6s,10s

默认情况下,下面3个的等待时长,都是跟上面那个是一样的,都是3s

  • spark.locality.wait.process
  • spark.locality.wait.node
  • spark.locality.wait.rack